转录组测序的转录组测序平台

Question

如题所述

Answer 1

随着亚太地区第一台Illumina Genome Analyzer Ⅱx测序仪进入天津生物芯片，可以提供测序读长为75*2 bp， 每次运行数据量达50-60GB。对于4-5Mb的基因组，可确保每个基因组测序量达到400Mb（100倍覆盖），足以满足全基因组denovo测序和SNP鉴定的需要。Solexa高通量测序平台均可对转录组进行测序，由于两种平台各有其优缺点，针对不同的样品情况，需灵活选用。Illumina测序技术的优点是单次测序获得的数据量大，能够得到更高的覆盖率，检测到更多低丰度的转录本，在已知基因组序列物种的转录组分析中更具优势。
Roche 454测序技术的优点是单序列读长可以达到500bp，在未知基因组序列物种的转录组分析中更有优势，其较长的读长便于拼接，能获得更好的转录本数据。
Phil Latreille等利用光学图谱研究了X. nematophila基因组，完成了基因组的组装。OpGen公司开发了一种新型的光学图谱技术。天津生物芯片技术责任有限公司于2012年引进国内首台基因组光学图谱，将传统测序技术与基因组光学图谱，可以提供更加完美的基因测序服务 。