根据《基本农田保护条例》，对于违反该条例的行为，将依据《中华人民共和国土地管理法》和《中华人民共和国土地管理法实施条例》进行相应的法律责任追究。以下是具体规定:
1. 未经批准或欺诈手段获取批准，非法占用基本农田的行为，将受到从重处罚，依据相关法律规定执行。（一）
2. 超过批准数量非法占用基本农田，同样会受到相应的处罚，包括对直接责任人进行行政或纪律处分。（二）
3. 对于非法批准占用基本农田的行为，上一级人民政府有责任责令改正，如不改正，相关人员将面临行政或纪律处分。（三）
4. 破坏或擅自改变基本农田保护区标志的行为，县级以上地方人民政府的土地或农业部门将进行处罚，包括恢复原状并可能面临1000元以下罚款。（四）
5. 占用基本农田进行非农活动，如建窑、建房等，严重破坏种植条件的，政府土地行政主管部门将要求改正或治理，罚款额度为占用耕地开垦费的一倍至两倍，若构成犯罪，则需承担刑事责任。（五）
6. 侵占挪用基本农田的耕地开垦费，不论是否构成犯罪，都将依法给予行政或纪律处分。（六）
我国人口多耕地少，耕地后备资源不足，维护国家粮食安全，保持社会稳定，始终是我国的一个重大问题。为此，国家专门制定《基本农田保护条例》 ，划定基本农田保护区，根本目的，就是为了对基本农田实行特殊保护，以满足我国未来人口和国民经济发展对农产品的需求，为农业生产乃至国民经济的持续、稳定、快速发展起到保障作用。