河南省人民政府发展研究中心设有多个职能处室，以高效地推动各项工作的进行。
第一个是办公室，主要职责包括协调各部门工作，负责文秘、会务、财务、资产管理等日常行政事务，确保机要保密和档案管理。此外，办公室还负责处理信访、政务信息和督查催办工作，以及制定并监督执行机关内部管理规定，同时保障后勤和保卫工作。
人事处（党委办公室）则承担机关及直属单位的人事管理、劳资和机构编制工作，负责纪检、监察事务，负责机关党务、政治思想工作以及工、青、妇相关工作，同时负责离退休人员的管理工作。
在专业研究方面，有综合研究处，其研究内容覆盖全省经济社会的中长期发展战略，关注跨领域、跨学科的重大问题，深入研究国民经济各产业的互动与协调发展，对经济动态进行深入分析，为省级重大经济决策提供研究和建议。
农村经济研究处专门研究农村经济体制、发展战略、劳动力转移等议题，关注农业可持续发展和城乡协调问题，为农村经济发展提供策略支持。
工业经济研究处则聚焦工业领域的研究，探讨发展战略、经济组织形式等问题，助力全省工业现代化进程。
河南省人民政府发展研究中心是省政府领导下从事河南经济与社会发展的综合性、长期性、战略性研究的决策咨询研究机构，为省政府直属事业单位(正厅级),依照公务员制度管理。为适应新形势下政策咨询研究的需要，更好地发挥高层决策咨询研究机构的作用，优化人员结构，提高队伍整体素质，河南省人事厅、河南省人民政府发展研究中心决定，通过考试、考核，面向社会公开招考7位具有博士、硕士学位的人员，主要从事农村经济、宏观经济、产业经济、区域经济、世界经济、市场管理和社会事业发展等相关领域研究工作。