北京协和医学院与清华大学合作招生，临床医学本科纳入清华大学总计划，由两校共同招生录取。报考者需在志愿填报时选择清华大学临床医学专业，并可兼报理工类专业。清华大学的学术优势和协和的医学实力将在此过程中得到充分发挥。双方将共同探索高校间紧密合作的新模式。
录取规则方面，八年制临床医学专业采用清华大学招生代码，录取原则与清华大学相同。护理本专科录取由北京协和医学院独立完成，护理本科为本科第一批。录取时，考生需达到各省控制线，按照招生计划的120%调阅档案，按分数从高到低录取。学校承认教育部加分政策，同等条件下优先录取。
护理录取、加分政策与清华大学一致。对往届生，学校一视同仁，但有特定体检要求，如色盲、色弱等疾病者不得录取医学类专业。此外，考生需通过肝功能和乙肝病毒表面抗原检查，不合格者可能影响专业就业。对于弄虚作假者，将取消入学资格。转专业方面，临床医学专业的学生大一、二在清华大学学习，转专业机会有限，而护理学专业则不可转。
北京协和医学院由美国洛克菲勒基金会于1917年创办，是我国最早设有八年制临床医学专业和护理本科教育的重点医科大学。2007年5月18日，中国协和医科大学正式更名为北京协和医学院。党中央、国务院和国家历届领导人对院校的发展十分关心支持。江泽民主席1997年亲笔为院校题写了“严谨、博精、创新、奉献”的院校训；胡锦涛主席对院校发展寄予了深切关注和殷切期望。 学校主页：http://www.pumc.edu.cn/
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