大家都知道，有机食品和绿色食品是相对的，但很多人不知道二者有什么区别，不知道该如何选择。
有机食品是指来自有机农业生产体系，根据国际有机农业生产要求和相关标准生产加工的，并通过独立的有机食品认证的一切农副产品。在生产中禁止使用化学合成的农药、化肥、生长调节剂、饲料添加剂等，同时禁止使用基因工程技术及该技术的产物及其衍生物。根据《绿色食品标志管理办法》规定，绿色食品标志为圆形图案上方印有“绿色食品”字样。
1、种类不同
有机食品包括粮食、蔬菜、水果、乳制品等，而绿色食品主要包括蔬菜、禽畜类产品，以及茶、咖啡、酒类等。此外，生产中允许使用农药残留、兽药及化学肥料等物质的在生产加工中不被禁用物质污染的产品也可称为绿色食品。
有机食品认证是需要满足以下几个条件：
第一，农业生产过程符合国际或国家有机食品发展大趋势和我国农业生产实际；第二，产品加工过程中不使用人工合成的农药化肥兽药及其他化学物质，并允许使用生物活性天然物质；第三，通过合法的认证；第四，产品包装上应标明产品的中文名称和有机标识注册号（又称“身份证”）；第五，生产地应具备必要的条件和能力。而绿色食品认证需要同时满足第二条和第三条。因此从这个角度来说，有机食品更具有权威性。
此外，有机食品是指来自于有机农业生产体系或野生天然产品。
2、认证机构不同
（1）绿色食品认证由中国绿色食品发展中心负责实施，证书由中国绿色食品发展中心颁发。
（2）有机食品是经专门机构认证，允许使用有机产品标志的无污染安全、优质、营养类食品。国际上公认的高品质农产品标志是“绿标的”，包括：蔬菜、水果、食用菌、畜禽产品、水产品及粮食类等，目前我国通过国家认证的有机产品生产基地面积不到全国耕地面积的1%，达到了8000多万亩，其中也包括了很多地方特产。但由于目前我国对有机农业还没有完善的技术标准和规范体系，有机农产品市场流通秩序还不够规范。因此我国有机产品认证机构只有一个——中国绿色食品发展中心。
（3）普通食品主要由生产厂家自己进行认证，产品质量由厂家负责管理。
3、监管标准不同
有机食品生产、加工必须符合《有机产品国家标准》，但对产品中重金属、农药残留、兽药残留等限量指标有严格要求。如《有机产品国家标准》规定，蔬菜类产品中重金属残留限量为：铅≤5 mg/kg、镉≤3 mg/kg、砷≤10 mg/kg、铬（六）7 mg/kg。
绿色食品生产基地要求土壤肥力指标要达到国家推荐值或国家标准要求。如《绿色食品产地环境技术条件》中对土壤肥力指标有明确规定：土壤有机质含量≥1.3%，速效氮含量≥30 mg/kg，速效磷含量≥25 mg/kg，速效钾含量≥120 mg/kg。
目前有机食品生产体系均严格遵循《有机产品》国家标准的要求。因此，从监管标准上来看，有机食品标准更为严格。
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