无证经营的话，违反了食品安全法第三十五条第一款的规定，根据《食品安全法》第一百二十二条第一款可以没收违法所得和违法生产经营的食品、食品添加剂以及用于违法生产经营的工具、设备、原料等物品；违法生产经营的食品、食品添加剂货值金额不足一万元的，并处五万元以上十万元以下罚款；货值金额一万元以上的，并处货值金额十倍以上二十倍以下罚款 ，所以处罚5万是合法的，不过针对你这种小商店在实践中一般不会予以直接处罚，但是如果你个人态度不好，惹怒了执法人员，你就自认倒霉吧。
追问处罚的附近几家都这样，有食品合格许可证，就连处罚的某种食品厂家都出示了合格证