1992年7月，明珠中学在黄浦区人民政府和上海市教育局的批准下，作为首批创办的五所民办学校之一，正式成立。
1997年5月，学校董事会成立，由包括上海恒源祥绒线有限公司在内的七家企业，以及黄浦区内的各界人士、教育界知名人士和明珠中学校长在内的成员组成。现任董事长为原黄浦区教育局党工委书记张俊明同志，实行董事会领导下的校长负责制。
同年7月，中共上海市民办明珠中学支部委员会成立，原上海市格致中学校长姜秀娥同志担任支部书记，进一步加强了学校的党组织建设。
2002年4月，学校工会成立，目前共有52名专职教职员工，其中共产党员占21名，高级教师占25名，师资力量雄厚。
2002年10月26日，全校师生在共舞台举行了盛大的集会，庆祝黄浦区第一所民办中学——明珠中学的十周年校庆，共享喜悦的时刻。
而到了2012年10月20日，上海市民办明珠中学再次盛装集会，全体师生在上海音乐厅欢聚一堂，共同庆祝明珠中学成立二十周年，回顾辉煌历程，展望美好未来。
上海市民办明珠中学是上海市民办中小学协会理事单位，是一所民办公助性质的全日制完全中学。上海市民办明珠中学创 建于1992年7月，是上海市首批创办的五所民办学校之一，由恒源祥绒线有限公司、培罗蒙西服总公司、华生化工有限公司等企业出资举办。