westernblot内参GAPDH成功了

如题所述

第1个回答  2022-06-19
2019-01-09 星期三 晴

说起昨天,真的很心酸。虽然以前看过同门大致做了一遍,但许多细节还是不清楚的。自己亲身体验才清楚。。。
1.蛋白测定之后要加5X SDS上样缓冲液,该怎么加呢?是所有的标本一起加了,还是就算准备上样的量?经中心试验室CWW指点后才知道,可以一起加了。就是把蛋白样品的体积除以4就是了,这样的5Xbuffer就变为了1X。
2.紧接着是配胶,也是一堆问题。过硫酸铵(AP),给我的是一支0.5g干粉,说明书说配成10%溶液,我先是拿1mlDDW稀释,然后去了100ul在稀释成1ml。结果依据产品说明书的要求配置分离胶,过了一个消失还是不能凝固。多方求教之后才发现AP,只有5%(Oh,my god!)。于是再取了100ul加入AP溶液中,这下就解决问题。 在配胶过程中,分离胶和浓缩胶所使用的SDS浓度是不一样的。一个1cm的胶,可能需要5ml的制胶液体。
3.配胶归配胶,分离胶的玻璃板如何安装才能不漏液也是一门技术活。我没有提前去把玻璃板清洁,只是临时把玻璃板清洗、擦干、再吹干。(这浪费了许多时间,故建议有自己专属的玻璃板,后者提前准备好。)在安装玻璃板的时候,要准备剥离板的底端要齐整,然后扣在制胶架上,要将绿色的卡夹下压到底,这样才能密切贴合。不然就像我那样,胶(前面提高胶不会凝固)就从缝隙里流光了。有人建议可以在剥离板上涂一些凡士林,有减少漏液的功效。
4.好不容易把胶制好了,开始跑电泳。电泳内槽也开始漏液,真是急死人了。(这时候,老病号的电话打过来了,之前和他约好11点的时候见面,安排复查事宜。两个事情堆在一起急死了。)肾内科的老师LLL建议我把电泳槽灌满电泳液,就没办法漏了,一开始想是个好办法,后来想想把胶重装一遍吧。在重装的过程中确实发现了问题所在,原来内槽上面有一个类似台阶的小疙瘩,之前没有注意到,没有将它配齐,故而留有缝隙,漏液了。于是针对性地重装了一遍,内槽不漏液了。开始电泳。电泳显示选择60V跑浓缩胶,跑了大概十分钟,发现没有啥动静,也没有传说中的泡泡冒出。认真核实了一下电路,没有接错之后,就赶紧去处理老病号的事情。临走之前还让麻醉的小兄弟JZT帮我瞄一眼。这位小兄弟一本正经地和我说,短路了。这可把我吓了一跳,赶紧电话追过去。原来他所谓的短路,是电泳内槽水漏没了。我十分悲伤地放下了电话,抱怨今天白忙活了。等我回到实验室,打开盖子,惊喜地发现电泳内槽水是满的。也发现了marker条带出来了。就是时间很久。大概过了一个消失,终于把分离胶跑完了。开始跑分离胶,设置100V,又过了一个小时,分离胶才跑了三分之一,于是把电压调到120V,又过了一个小时,分离胶才跑了三分之二。眼瞅着下午五点了,而且内参的条带已经出来了,索性把电压调到了150V,没到半小时,就跑完了。
5.转膜。电泳的过程相对比较顺利。不过切胶也切了我大半天,犹豫怎么下手就花了10分钟,现在想来,就是目标条带的判断准确之后,先切去浓缩胶和不要的孔道,然后切去剩下的分离胶。剪PVDF膜和活化膜,比较顺利。在“三明治”的配置过程中,耽搁了一会儿。一定要切记胶和膜的对应方向,膜上还要做个标记,以便判断蛋白所在的位置。开始电转的时候,已经快七点了,一看protocol要60V电转2小时,当时就有些想放弃了。好在问了一位高手YRL,她建议300mA电转45分钟就可以了。我一听一下子轻松了不少。
6.封闭。5%牛奶封闭了一会儿,直接扔冰箱里了。因为已经体力不支了,所以电脑也没带回去。在这期间我把病理切片的名单写在了载玻片上面,算是弥补了一点原本当天要完成的工作。

今天,早早地过去,就是希望把westernblot的流程完成了。
1.洗膜。1X TBST洗膜,这个我已经提前配置好了,没有压力。5minX3次。
2.孵一抗。按照GAPDH说明书,1:4000稀释一抗。我还以为4ml的一抗稀释液要16ul的抗体。我一想,有点不合理吧。我买的GAPDH总共才25ul,一次性全部用了。好在问了肾内科的LLL,跟我解释了一下。原来是抗体和一抗稀释液的配比是1ul和4000ul,果然这样才合理。就这样开开心心地常温孵化抗体3h。在这期间去了趟病理科,把昨天弄好的病理组织块切回来,准备下一步免疫组化。
3.去完病理科,吃了个午饭,没有休息继续奋斗。到细胞房惊喜地发现放在别人细胞层的140细胞居然一点污点都没有。这是细胞培养箱的问题吗?还是我一直怀疑的培养基问题,抑或是培养液没有提前预热的问题?总之,细胞状态很好,就准备一传三,同时冻存一部分。而这次510又开始一反常态,污点变多了,但没有之前增殖那么快,所以今天510我全部扔了。同时将第一次的510复苏了。希望你要好好的,明天见分晓。
4.回收一抗。(请注意,如果你要回收抗体,建议将抗体在冰上孵育,以保证抗体质量)。TBST洗膜三遍,5minX3次。
5.孵二抗。就简单多了。按说明书1:5000稀释,于是乎,二抗和二抗稀释液的配比是1ul和5000ul,继续常温孵化了2h。回收二抗。TBST洗膜三遍,5minX3次。
4.ECL曝光。今天很幸运,在曝光的时候碰到之前认识的一个小兄弟HMT,还认真地教我一遍,包括具体的方法及其选择事由。这次曝光发现了内参还是比较整齐,其上混有一些杂带。继续找人帮我解决。

于是乎,到今天下午,我总算把WB的流程磕磕碰碰地做了一遍,算是小有结果吧。明天看一下M3的曝光情况。期待明天SZM同学给我带来新的食管细胞109和709。还有继续筹备免疫组化的东西,落实het-1a细胞的状况。。。

附: Elivision二步法免疫组化染色步骤
1 石蜡印片脱蜡和水化后,用PBS(pH7.4)冲洗二次,每次3分钟(3x3min)
2 根据每种抗体的要求,对组织抗原进行相应的修复。
3 如果有必要,每张切片加1滴或50ul的3%H202,室温孵育10分钟,以阻断内原性 过氧化物酶的活性。PBS冲洗3x3·.
4 除去PBS液,每张印片加1滴或50ul第一抗体(用户自选),室温孵育60分钟或4'C 过夜,建议参见每种抗体的说明书。
5 PBS冲洗3x5’。除去PB5液,每张印片加1滴或50ul聚合物增强刑(试剂 A ),室腽孵育20分钟.PBS冲洗3x3.
6 除去PBS液,每张切片加1滴或50ul酶标抗鼠/免聚什物(试剂 B ),室温孵育30分钟。PBS冲洗3x3·.
7 除上PBS液,每张切片加1滴或5Oul新鲜配制的DAB或AEC溶液,显微镜观察3~5分钟( DAB )或10分钟( AEC )。
8 自来水冲洗,苏木素复染,若有必要,可用0.1%HCl分化自来水冲洗,PBS返蓝.
9 如果用DAB显色,则切片经梯度酒精脱水干燥,(二甲苯透明),中性树胶封片,如果用AEC显色,则切片不能酒精脱水, 而直接用水性封片剂。
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